Εργαστήριο Συνθετικής Βιολογίας
Ένα σύγχρονο εργαστήριο βιοτεχνολογίας είναι πολύ περισσότερα από ένας χώρος με όργανα – αποτελεί την πνευματική και τεχνολογική καρδιά της επιστημονικής εκπαίδευσης και καινοτομίας. Για τους φοιτητές που συμμετέχουν στο διπλό μεταπτυχιακό πρόγραμμα στη Συνθετική Βιολογία μεταξύ Πανεπιστημίου Θεσσαλίας και McGill University (υπό τελική έγκριση), η πρόσβαση σε υπερσύγχρονες εργαστηριακές υποδομές είναι θεμελιώδης για την ακαδημαϊκή και επαγγελματική τους εξέλιξη.
Η συνθετική βιολογία είναι διεπιστημονικός τομέας που ενσωματώνει μοριακή βιολογία, μηχανική, υπολογιστική ανάλυση και βιοτεχνολογία για το σχεδιασμό και την κατασκευή νέων βιολογικών συστημάτων. Η πρακτική εμπειρία με προηγμένα όργανα είναι απαραίτητη για την αποτελεσματική εκπαίδευση των φοιτητών σε αυτόν τον απαιτητικό και ταχέως εξελισσόμενο τομέα. Ένα καλά εξοπλισμένο εργαστήριο δίνει τη δυνατότητα στους φοιτητές να εφαρμόσουν πειραματικές τεχνικές, μοριακές μεθόδους, μικροβιακή μηχανική, ανάλυση omics και έρευνα βασισμένη στη βιοπληροφορική.
Η έκθεση σε αυτοματοποιημένες πλατφόρμες, τεχνολογίες υψηλής απόδοσης και υπολογιστικούς σταθμούς αντικατοπτρίζει το περιβάλλον κορυφαίων διεθνών ερευνητικών κέντρων και βιοτεχνολογικής βιομηχανίας. Αυτό εξασφαλίζει ότι οι απόφοιτοι του προγράμματος είναι ακαδημαϊκά και τεχνολογικά έτοιμοι και ανταγωνιστικοί σε παγκόσμιο επίπεδο. Οι υποδομές αυτές ενισχύουν την πειραματική ακρίβεια, την καινοτομία, τη συνεργασία και την τεχνική αυτοπεποίθηση, αποτελώντας τη βάση για την εκπαίδευση της επόμενης γενιάς συνθετικών βιολόγων.
Λίστα Εργαστηριακού Εξοπλισμού:
Αυτοματισμός και Συστήματα Υψηλής Απόδοσης (High-Throughput)
- Αυτοματοποιημένα συστήματα διαχείρισης υγρών (liquid handling) και ρομποτικές πλατφόρμες για την προετοιμασία δειγμάτων, την απομόνωση νουκλεϊκών οξέων, την κατασκευή βιβλιοθηκών αλληλούχησης και τις διαδικασίες ποσοτικής PCR (qPCR).
- Αυτόματος συνθέτης ολιγονουκλεοτιδίων και ρομποτικό σύστημα κρυστάλλωσης για εφαρμογές αυτοματοποιημένης σύνθεσης και δομικής βιολογίας.
PCR και Ψηφιακή Ενίσχυση Νουκλεϊκών Οξέων
- Συστήματα PCR, qPCR, PCR πραγματικού χρόνου (Real-Time PCR) και ψηφιακής PCR (Digital PCR) για την ενίσχυση και ποσοτικοποίηση νουκλεϊκών οξέων.
Αλληλούχηση Νέας Γενιάς (Next-Generation Sequencing)
- Πλατφόρμες αλληλούχησης Illumina iSeq/MiSeq και Oxford Nanopore MinION.
- Σύστημα TapeStation Bioanalyzer για τον ποιοτικό έλεγχο και τον προσδιορισμό του μεγέθους νουκλεϊκών οξέων.
Απεικόνιση και Ανίχνευση
- Συστήματα μικροσκοπίας φθορισμού, συνεστιακής (confocal) και μικροσκοπίας αντίθεσης φάσης.
- Συστήματα απεικόνισης πηκτωμάτων (gel imaging), ανίχνευσης χημειοφωταύγειας και πολυλειτουργικοί αναγνώστες μικροπλακών (multimodal plate readers).
Χειρισμός Κυττάρων και Μικροσκοπικών Δειγμάτων
- Συστήματα μικροέγχυσης (microinjection), ηλεκτροδιάτρησης (electroporation) και κατασκευής μικροπιπετών για εφαρμογές κυτταρικού χειρισμού.
Καλλιέργεια Κυττάρων και Μικροοργανισμών
- Επωαστικοί θάλαμοι CO₂, θάλαμοι νηματικής ροής (laminar-flow hoods), επωαστικοί θάλαμοι μικροοργανισμών και ολοκληρωμένες εγκαταστάσεις κυτταροκαλλιέργειας.
Επεξεργασία και Αποθήκευση Δειγμάτων
- Φυγόκεντροι, υπερφυγόκεντροι, καταψύκτες υπερχαμηλής θερμοκρασίας και συστήματα αποθήκευσης υγρού αζώτου.
Αναλυτική Χημεία και Δομική Βιολογία
- Συστήματα φασματοφωτομετρίας, ηλεκτροφόρησης σε πηκτή, υγρής χρωματογραφίας υψηλής απόδοσης (HPLC), υγρής χρωματογραφίας–φασματομετρίας μάζας διπλού σταδίου (LC-MS/MS), ταχείας πρωτεϊνικής υγρής χρωματογραφίας (FPLC) και πρωτεϊνικής κρυσταλλογραφίας.
Βιοδιεργασίες, Φυτικές Επιστήμες και Τεχνολογία Τροφίμων
- Βιοαντιδραστήρες, θάλαμοι ανάπτυξης φυτών, εγκαταστάσεις εκτροφής εντόμων (insectary facilities) και μονάδες επεξεργασίας τροφίμων και αισθητηριακής αξιολόγησης.
Υπολογιστικές Υποδομές
- Υπολογιστικοί εξυπηρετητές υψηλών επιδόσεων (High-Performance Computing – HPC) και εξειδικευμένοι σταθμοί εργασίας για αναλύσεις «omics», δομική βιολογία και ανάλυση βιολογικών δεδομένων.